Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZCCHC2Q9C0B9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZCCHC2Q9C0B9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms