Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2Q9BX26 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms