Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAGR1Q9BTK6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms