Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms