Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MGME1Q9BQP7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MGME1Q9BQP7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms