Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT140Q96RY7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT140Q96RY7 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms