Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SAMD8Q96LT4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms