Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP47Q96K76 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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