Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZNF479Q96JC4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms