Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHFRQ96EP1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms