Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LRTOMTQ8WZ04 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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LRTOMTQ8WZ04 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRTOMTQ8WZ04 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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