Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC8Q8TC99 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC8Q8TC99 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms