Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms