Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM35BQ8NCS4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms