Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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UBE2Q1Q7Z7E8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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UBE2Q1Q7Z7E8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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UBE2Q1Q7Z7E8 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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UBE2Q1Q7Z7E8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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UBE2Q1Q7Z7E8 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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UBE2Q1Q7Z7E8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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UBE2Q1Q7Z7E8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2Q1Q7Z7E8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2Q1Q7Z7E8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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