Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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