Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF7Q6Q0C0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms