Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms