Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms