Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCID2Q5JVF3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCID2Q5JVF3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms