Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNT1Q5JUK3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms