Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL22Q53GT1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms