Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN2Q52LD8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms