Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GREB1Q4ZG55 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GREB1Q4ZG55 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms