Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RTL8BQ17RB0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms