Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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