Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NTRK2Q16620 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NTRK2Q16620 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NTRK2Q16620 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NTRK2Q16620 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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