Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSRP2Q16527 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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