Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
GABRA6Q16445 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms