Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PDCD2Q16342 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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