Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms