Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNA2Q15822 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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