Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CDSNQ15517 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CDSNQ15517 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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