Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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