Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms