Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SSPNQ14714 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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