Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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