Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ERV3-1Q14264 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ERV3-1Q14264 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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ERV3-1Q14264 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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