Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
EBI3Q14213 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms