Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCARF1Q14162 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCARF1Q14162 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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