Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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