Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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DDX39BQ13838 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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DDX39BQ13838 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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