Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHROOM2Q13796 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms