Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NCOA4Q13772 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NCOA4Q13772 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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