Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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