Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PMS2P11Q13670 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms