Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FHL3Q13643 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FHL3Q13643 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FHL3Q13643 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FHL3Q13643 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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FHL3Q13643 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FHL3Q13643 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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