Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CUL4BQ13620 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CUL4BQ13620 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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