Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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