Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BFSP2Q13515 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BFSP2Q13515 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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